В 1991 году, когда Центральноазиатские государства обрели независимость, регион вступил в динамичный мир свободного рынка и демократии. Новое поколение предложило свежий взгляд на использование экономических ресурсов, распространение информации и реализацию личной свободы в условиях открытого общества. Эти перемены стали основой для инноваций в образовании, что привело к созданию Кыргызско-американского факультета (КАФ) при Кыргызском государственном национальном университете (КГНУ) в 1993 году.
Вскоре КАФ начал стремительно развиваться, и его возможности в рамках факультета КГНУ стали ограничены; возникла необходимость в преобразовании факультета в независимое образовательное учреждение. В 1997 году, по указу Президента Кыргызстана, КАФ был преобразован в Американский университет в Кыргызстане (АУК), и для управления университетом был создан независимый международный Совет попечителей.
АУК быстро завоевал международное признание как университет, основанный на принципах свободы и критического мышления. Этот новый подход к образованию в Центральной Азии привлек в университет молодых ученых из тридцати стран. В 2002 году, когда миссия университета и его видение будущего значительно расширились, отражая его региональное значение, Совет попечителей принял решение переименовать университет в Американский университет в Центральной Азии.
С момента своего основания АУЦА зарекомендовал себя как учебное заведение, преданное демократическим ценностям, личной свободе и духу новаторства, сыграв важную роль в образовательной системе стремительно развивающегося региона. Сегодня АУЦА продолжает двигаться вперед, предлагая образовательные программы, соответствующие международным стандартам и учитывающие потребности региона. Это делает университет не только лидером в Центральной Азии, но и значимым игроком на глобальной образовательной арене.